Skupina za epidemiologijo skrbi za preventivno zdravstveno dejavnost na področju epidemiologije nalezljivih bolezni za območje ZZV Koper. Temeljna naloga Oddelka za epidemiologijo je oblikovanje enotne medicinske doktrine in uvajanje novih metod dela na področju epidemiologije nalezljivih bolezni. Aktivnosti Oddelka za epidemiologijo so izvajanje nalog, ki so zakonsko predpisane, zlasti z Zakonom o nalezljivih boleznih, ter izvajanje nalog s smernicami nacionalnega programa, ki se nanašajo na epidemiologijo nalezljivih bolezni. Oddelek za epidemiologijo spremlja in preučuje gibanje nalezljivih bolezni na svojem območju, v Republiki Sloveniji ter po svetu in sproti izvaja ustrezne epidemiološke ukrepe. Na področju izvajanja imunizacijskega programa spremlja potek obveznih cepljenj po programu za predšolske in šolske otroke ter mladino in tako ocenjuje stanje precepljenosti na svojem območju. V primeru pomanjkljivosti pri izvajanju imunizacijskega programa nudi strokovno pomoč za odpravo leteh. Spremlja tudi izvajanje cepljenja proti tetanusu in ostala neobvezna cepljenja. Oddelek za epidemiologijo izvaja tudi vsa obvezna cepljenja iz imunizacijskega programa za posebne skupine prebivalstva in sicer:
- cepljenje kontaktov in družinskih članov nosilcev HbsAg proti hepatitisu B
- v jesensko zimskem času cepljenje proti gripi in pnevmokoku, priporočeno zlasti ogroženim skupinam prebivalstva
- cepljenje potnikov v mednarodnem prometu in svetovanje pri potovanjih.
Za preprečevanje stekline pri ljudeh, strokovno sodeluje z veterinarsko službo in veterinarsko inšpekcijo, spremlja gibanje stekline in poškodovancem nudi ustrezno strokovno pomoč. Oddelek za epidemiologijo sodeluje na strokovnih kolegijih, organiziranih na Inštitutu za varovanje zdravja RS in nudi strokovna navodila zdravstveni službi s ciljem preprečevanja nalezljivih obolenj. Mesečno pripravljamo Epidemiološki poročevalec s katerim posredujemo zdravstveni službi na območju ZZV Koper gibanje nalezljivih boleznih po občinah ter aktualne teme s področja epidemiologije nalezljivih bolezni. Oddelek za epidemiologijo vidi svojo bodočnost v nadaljevanju strokovnega razvoja. V preteklosti smo bili higiensko-epidemiološka služba, ki je vso svojo energijo in znanje uporabljala za zatiranje nalezljivih bolezni.